大学是教学与研究的圣殿，独立精神与自由思想是它坚实的根基。要继续扮演好这崇高的角色，大学无疑要留住这根基。

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当年蔡元培踏足北大，怀揣“兼容并包，思想自由”的良策，在麾下招纳了大批贤良之士，成就现代百家争鸣，这是对自由思想的推崇；罗家伦在清华改隶废董，这是希望大学独立于行政；梅贻琦曾言：“大学之大，在大师也，非在大官也”，这是希图教授治校，也是不愿攀附于官员；至于胡适破格录取罗家伦及其著名箴言“教育当引导社会，而非随逐于社会也”，则说的是大学当摒弃世俗偏见，独立于舆论严威。可以说，近代史上中国大学拥有良好开端，以其独立自由的根本精神开启了一个波澜壮阔的时代。

随后便是高等教育史上两个节点：1952年的院系调整，1977年的恢复高考。此后，高校如雨后春笋般涌现，高等教育突飞猛进。进入新世纪，大学的蓬勃发展方兴未艾，中国也开始迈入高等教育大众化的时代。然而发展中的弊端日渐显露，大学的繁枝茂叶下是土壤的贫瘠和根系的孱弱。

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北京大学中文系教授温儒敏指出，中国大学有五大弊端。仅以项目化为例，名教授不喜教本科，竞相争取研究项目及科研资金或者竭力创收。这在耶鲁大学等美国大学是严令禁止且得到良好贯彻执行的。还有，当年中央美院一年级新生由徐悲鸿亲自教授素描入门，这一点也足以让当今许多教授自惭形秽。

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当前名校饱受诟病的招生政策明显向城市、向“优秀生源基地”倾斜，造成农村学生比例极低的惊人现象。清华大学在百年校庆时的`宣传册上以官职高低而非资历或成就给校友排位也引来一片质疑，舆论认为这是官本位思想的外在表现，是大学向权利献媚。像温儒敏总结的，这一切严重腐蚀了近代以来形成的现代大学精神。大学的根发生软化甚至动摇。

要留住大学精神，当有校长的非凡魄力，有独立健全的运行体制，有浓厚纯正的学术氛围和卓越的眼光和定位。南方科技大学作为高校改革的试点，在全球招募校长，自主招生，独立于高考。其校长朱清时在中科大任校长是深觉束缚，希冀在深圳开辟新一片天地。他如今携南方科技大风雨前行改革之路任重而道远。

陈丹青曾问：今日的北大可还是蔡元培的北大？清华还是梅贻琦的清华？要给出肯定的答复，还需中国大学守住独立自由，把根留住。