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就在赛尔号队员们取得“绿宝宝”能源将要出发时，邪恶海盗团利用千年雪狐使出了终极技能-时空转换。所以，赛尔号队员们被卷进了远古时代。

这时，发明家肖恩惊讶地说：“这里是哪”？带着疑问的赛尔号成员们慢慢往向前走。突然，有一个很小的神兽，他的名字叫“瑞诺”，发明家肖恩立即打开了精灵查询机，却怎么也查不到，他们认为这就是传说中的四大神兽之一，便一起同行。走到中途，瑞诺停了下来，吱吱的叫了起来，发现地上有一个龙族图标，认为这就是时空之门，但怎么也打不开。这时，瑞诺坐在了图标上，须臾，天上出现了一个旋涡，将他们卷了进去，到了未知世界……

在悠久的时空旅行中，他们的命运会如何呢。