从前有一个14岁的小男孩，名叫尼尔斯。不爱读书的他特别顽皮捣蛋，但他的父亲和母亲却十分善良，而且勤劳。

　　尼尔斯经常很过分地捉弄家里的小动物，因此那些奶牛、鸡和鹅一看见他就会跑。

　　一天他的父母出去了，尼尔斯独自在家却遇到了小精灵，后来因为捉弄小精灵，尼尔斯就被小精灵变成了拇指大的小人儿。

　　尼尔斯要找到小精灵，可换来的是鸟的嘲笑，牛的气愤，猫的伤害……一群大雁从头顶上飞过，它们问家里的大鹅走不走，再三思考后大鹅跟了上去，为了阻止大鹅，尼尔斯抓住大鹅的脖子。可是已经晚了，尼尔斯开始了骑在大鹅背上的旅行。

　　在庄园里休息的时候，因为尼尔斯出手相救，狡猾的狐狸没有在大雁那儿得到便宜，这使尼尔斯在雁群中得到了一点信任。

　　男孩和雄鹅在旅行中结下了深深的友谊，可插曲打乱了计划，难得一次的鹤之舞中却藏着危险。

　　狐狸贼心不死，总想抓大雁，可每一次就要抓到的时候，都有尼尔斯的阻拦。为了躲避狐狸偷袭，雁群降临在卡尔斯克鲁纳城。在这里，他又受到了青铜大汉的追赶，幸运的他得到帮助，他的内心也在一点点改变。

　　在飞行中，他第一次站在大雁的角度上，意识到了人类的凶残，意识到要和动物们好好相处。

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　　在经过生死的磨练后，尼尔斯更加懂事了。雁群和尼尔斯几乎成为了动物们的守护神。回到家后，尼尔斯得知父母要炖了大鹅，经过挣扎的尼尔斯勇敢地冲出来保护大鹅……他经受住了小精灵的考验，在他冲出来的那一瞬间，尼尔斯终于变回了正常的样子。