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太古时候，缺医少食，人们经常得病死亡，神农帝为此很犯愁，决心尝百草，定药性，为大家消灾祛病。

一回，花蕊公主得病，调治多次无法医好，神农抓了十二味药材，招呼花蕊公主吃下，自己走了。花蕊公主吃过后，生下一只小鸟，这可把人吓坏了，都说它是个妖怪，赶紧把它弄出去算了。小鸟通人性，便去地里找神农。

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神农被小鸟喊外公吵醒，觉得心烦便把小鸟撵走。没多大一会儿，小鸟又飞回来喊外公。神农氏一共赶了三次，每一次过后小鸟都飞回来。神农为测试它是否通人性，便招呼小鸟飞到它的左手脖上。神农细看这小鸟，浑身翠绿，透明，高兴透了。

神农高兴地把小鸟带回家，家里人一看，慌忙地连说快放了那妖怪。神农笑着说，这不是妖怪，而是宝贝！给它取名花蕊鸟。神农又把花蕊公主吃过的十二味药分开在锅里熬，每熬一味，就喂给小鸟吃一味，看此药到小鸟肚里往哪走，有何变化。再亲口尝尝在自己肚里又是什么滋味。尝妥了，发现这药一共走了手足三阴三阳十二经脉。

神农托着这只鸟上山，摘取药草与小鸟一起尝，天长日久，神农便制定出人体的十二经脉和《本草经》。有一次，神农捉全冠虫喂小鸟，这虫毒气太大，小鸟断肠而死。神农用木材刻了一只鸟，走哪带哪。后来神农也因误尝断肠草而死。

为纪念神农，人们把小北顶改名为神农坛，世世代代纪念神农。