有个淘气的男孩，他叫尼尔斯。因为他捉弄小精灵，被变成了小狐仙。他想要让动物们帮忙，可动物却嘲笑了他。他看见家里最大的鹅与大雁要飞走了，他怕父母伤心，所以去阻止雄鹅莫顿，却被鹅带上了天空。

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雁群并不信任尼尔斯，认为他和所有人一样会伤害大雁，一路上，他们遇到了重重困难：莫顿飞的不好，尼尔斯因为找不到食物差点饿死，被狐狸斯尔米抓走…但是聪明的尼尔斯把他们全化解了。他用尽自己全身的力量救了莫顿，最终获得了莫顿的信任。他又从斯尔米手中救下了大雁领头阿卡，也成功的取得了雁群的信住。就这样，他也习惯了这场漫长而惊险的旅行。

在旅行的途中，尼尔斯用他的机智与狡猾的狐理斯尔米作斗争，破坏了他的诡计。他不畏艰险和困难，智取了强盗山的乌鸡。之后他又打败了灰老鼠兵团…在这次的旅行中，尼尔斯看到了自己祖国的大好河山，认识了许并多多的朋友，还有了很多的见闻，听到了许多奇妙的传说。经历了各种闲难。他从伙件和小动物的身上学到了助人为乐、含已为人的好品质，改掉了不善良捉弄小动物的缺点，从一个顽皮的孩子变成了心地善良的孩子！

经历了困难后，尼尔斯也变回了原形重新与父母在一起生活了！可令尼尔斯难过的是燕群再也不认识她了。