神奇宝贝世界原来是个和平的地方，可是，由于神兽烈空坐横行霸道，带动固拉多和盖欧卡一起霸占一方，神奇宝贝们苦不堪言，这时，一位少年站出来，踏上了和神兽抗争的旅途。它，就是皮卡丘。

第一章：到达火之村

皮卡丘出发前，村长电龙给了它音速拳的秘籍，说：“你到了火之村，过了森林就到了草之村，那里的村长喇叭芽长老会给你一个袋子，记住，只有使用了袋子里面的东西后才能使用秘籍！”“知道了！”皮卡丘回答。皮卡丘离开电之村，走了很久，不知不觉地睡着了。

第二天，皮卡丘发现自己已经在火之村里了，这时，房门开了，进来一只小火龙：“嘿，睡得香吗？昨天我发现你睡在路上，就把你带回了家。”皮卡丘还没来得及说话，一个声音打破了宁静：“村长，你给我滚出来！你敢和我决斗吗？”原来是喷火驼在叫骂。村长九尾走了出来：“你怎么又来了，真是自不量力！”“我就这样，怎么了？”喷火驼瞪了村长一眼。“接招，岩崩！”这时，所有的石头打向喷火驼，效果不一般！“啊！可恶，我一定会回来的！”喷火驼跑开了。坏人被赶走了，村民们一阵欢呼。离开火之村前，小火龙问皮卡丘：“我能和你一起走吗？”“当然可以！”皮卡丘笑着说。村长给了小火龙一盘秘籍，说：“你也长大了，给。这是不变的秘籍。”于是，皮卡丘和小火龙踏上了去草之村的旅途。

第二章：森林里的强盗

皮卡丘和小火龙走了一天，都不见草之村的踪影，因为它们在森林里迷路了。这时，从树上窜下来一只狡猾天狗和一群长鼻叶，它们大叫：“过路留下买路钱！”小火龙走上前，摸着狡猾天狗的额头说：“没发烧啊，你们草系怎么可能对付我们火系呢？”“有本事你就来啊！”狡猾天狗挑拨小火龙。“看招，火花！”小火龙把火花吐向狡猾天狗。“兄弟们，出招，岩石封闭！”成群的岩石挡住了火花，砸向了小火龙，效果不一般！“啊！可恶！再来一次。”结果和上次一样，怎样才能打破这些岩石呢？突然，小火龙好象想到了什么。它拿出秘籍，装在身上，冲向狡猾天狗它们，狡猾天狗看它又冲过来了，又使出了岩石封闭。“看招，不变！”一眨眼，岩石被打碎了，灰尘满天，突然又亮光四射。皮卡丘刚睁开眼睛，看到的是：“小火龙？”不，站在眼前的是，火恐龙。“喷射火焰！”火恐龙从嘴里吐出炽热的火焰。“大人，小的以后再也不敢了!” 狡猾天狗跪地求饶。 “告诉我去草之村的路，不然的话，哼哼……”“是，从这里直走就到了。”“走吧，皮卡丘。”它发现，皮卡丘呆呆地站在那里，眼睛都发直了。终于，它们来到了草之村。

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第三章：大针蜂的阴谋

皮卡丘它们到了草之村，发现村民已经在热烈地迎接它们了。它们一进村长家大门，就发现时间已经是晚上六点，在与喇叭芽长老共进晚餐时，皮卡丘问村长：“长老，村长告诉我您这里有一个袋子，现在能给我了吗？”“先吃晚餐吧。”村长说。皮卡丘还没有吃上一口，巨大的嗡嗡声传遍了整个村子。“不好，是大针蜂那群土匪来了！”村长大叫。“怎么回事？长老。” 皮卡丘问。“自从固拉多摧毁虫之村之后，它们就一直来这捣乱，想把这里变成新的虫之村。”这时，大针蜂冲进来，抓起村长，扔到外面，说：“想让村长活命，就别轻举妄动，否则……”“不要管我，打败这些家伙。”村长说。“长老！”皮卡丘眼里泛起了泪珠。“给你，这是你们村长叫我交给你的袋子。”村长说着扔出一个袋子。“老家伙，还敢做小动作。”大针蜂说着使出了毒针。“啊……战斗……”村长永远地闭上了眼睛。皮卡丘立刻打开袋子，一块金黄的、刻着闪电的石头出现在眼前，皮卡丘顾不上这么多了，拿起它放在胸前，石头融入了它的身体里，它又拿出秘籍，装在身上，忽然觉得身体里有一种还没有爆发的力量。它对火恐龙说：“想不想给这些土匪一拳？”“求之不得！”火恐龙大叫。“不变！”“音速拳！”两只大针蜂被打了下来，皮卡丘发现，火恐龙长出了翅膀……它已经是喷火龙了。“小鬼们，我们会再来的，给我记住！”大针蜂头领带着大针蜂们狼狈地逃走了。村民们欢呼起来，可是，皮卡丘却怎么也高兴不起来。因为村长永远地离开了它们。皮卡丘问村民们：“刚才的那块石头是什么？”“那是雷电石，专门给你这种独特的神奇宝贝进化的。”这时，皮卡丘才发现，它不是皮卡丘了，它是一只雷丘了。这个时候，一只木守宫走过来，说：“长老说我长大了，要我和你们一起旅行。”“那我们走吧。”“下面一个村叫大地村，我带你们去吧。”于是，它们往大地村进发。

第四章：突击，地鼠洞穴

雷丘它们正在前往大地村的路上，突然，它们掉进了一个洞穴。“哎哟，摔死我了。”雷丘抱怨。“这里是什么地方？”喷火龙问。“这里好象是地鼠洞穴。”木守宫回答。突然，冒出了一只三地鼠和一大群地鼠：“你们敢侵犯我们的地盘？”“等等，我们马上出去。”雷丘回答。“不行，现在就出去！”三地鼠怒吼。“敬酒不吃吃罚酒，种子机关枪！”木守宫大叫，成群的种子打向三地鼠。“兄弟们，挖洞！”三地鼠带领地鼠们拈入地中，种子机关枪没有打中它们。“到哪里去了？”木守宫疑惑地看看四周。“流沙地狱！”三地鼠像蚁狮一样制造了一个巨大的“陷井”， 木守宫陷了进去。“哈哈哈哈，”在木守宫下陷的一瞬间，“劈开！”“啊，你们不用插手，我自己来打败它，刀叶！”只见木守宫头上长出了叶子，它进化成森林蜥蜴了。“啊，别打了，我送你们上去。”三地鼠求饶。终于，它们被送到了大地村。

第五章：对战尼多王

雷丘它们到了大地村，见到了村长尼多王。它们发现，村长家里还有一只无壳海牛，雷丘问村长：“这只无壳海牛是水系的，为什么会在大地村？”“因为我们认为它会进化成水加地面系的海蜗牛。”村长回答。吃完午饭，雷丘问村长：“我们现在可以出村了吗？”“你们要去干嘛？”“去打败固拉多。”“不行，没有固拉多大王的命令，谁也不许去陆地洞窟！”“那我只能打败你再去喽？”森林蜥蜴说。“来吧，我可不会手下留情！”“看招，刀叶！”“别忘了，我可是毒加地面系的，毒炸弹！”成群的毒液挡住了刀叶，效果不一般。“啊！可恶，让我想想，喇叭芽长老生前教我背过的属性知识……”森林蜥蜴开始冥想。“我们先替它顶一下。”雷丘说。“也好。”喷火龙回答。“伏特攻击！”“爆炸燃烧！”“雕虫小技，地震！”喷火龙还可以忍住，可是，对于雷丘来说，效果不一般！“我知道了，岩克毒。”森林蜥蜴想到了。森林蜥蜴又沉思了一会儿，然后马上使出了绝招：“岩石威力！”一个巨大的岩石球砸向了尼多王，效果不一般。“嗯……不错！可以过去了。”尼多王说，“不过，把无壳海牛也带走吧！”临别前，尼多王给了无壳海牛一盘秘籍，说：“这盘秘籍给你，不过，现在还不能看。”雷丘它们向着陆地洞窟前进。

第六章：决战固拉多

雷丘它们打败了尼多王，来到了陆地洞窟所在的烟囱山，它们刚爬上了第一层，大钢蛇就对它们发起了攻击：“沙雹！”顿时，黄沙弥漫，喷火龙说：“我的属性克到它，我留下来对付它。”到了第二层，地面上不断地出现大颚蚁，使用咬碎摧毁上面的一切。“我用岩石威力送你们过去，我在这里对付它们。”森林蜥蜴说。第三层，雷丘发现，固拉多就在面前。先看看第一层，大钢蛇对喷火龙使出了铁尾，喷火龙迎面而上，使出了爆炸燃烧，啊~哦~，引起的爆炸使它们两个都掉到山谷里去了，还好喷火龙会飞，不然就惨了。再看看第二层，森林蜥蜴快多了，使用刀叶直接扫平了这些家伙。“小鬼们，你们终于来了，接招，暴烈钳！”固拉多对雷丘发起了攻击，这时，岩石威力挡住了暴烈钳，原来是森林蜥蜴和喷火龙来了。“看我的，刀叶！”森林蜥蜴先发制人。“你以为这就对付得了我？大字爆！”巨大的火焰挡住了刀叶，效果不一般！“啊！我不行。”“那我来，急冻光线！”无壳海牛吐出了冷冻光束。可是，光线一打在固拉多身上，结的冰立刻就化了。“哈哈，就这点小技俩是奈何不了我的！”固拉多笑道。无壳海牛立即拿出秘籍装在身上，然后冲向固拉多。“别去！急冻光线对它没有用！”雷丘叫道。“没事，因为我要使出更大的绝招——绝对零度！”“啊！”固拉多被冰封了起来，忽然，冰碎了，又亮光四射。雷丘发现，无壳海牛进化成了乘龙。“不错！我甘拜下风！”固拉多认输了，“要去打败盖欧卡，得去水之村，要去水之村，我送你们一程，地裂！”地面裂了开来。雷丘它们掉进了地洞，它们醒来时，已经被三地鼠送到了离水之村不远的地方，它们向着水之村前进。